При этом не были исключением случаи, когда в одном экссудате выделяли 7-9 видов. Отмечалось умеренное преобладание анаэробов, ведущая роль среди которых принадлежала бактероидам. В некоторых группах на первом месте были Е. coli, что, очевидно, связано со стадией процесса замещения, наблюдающегося в бактериальной смеси. При перитонеальном сепсисе бактероиды и Е. coli выделяют также из крови больных. На третьем месте стоят стрептококки, пептострептококки и пептококки. Среди остальных бесспоровых анаэробов часто встречаются эубактерии и пропионибактерии. Некоторые авторы отмечают нередкое нахождение клостридий, однако это скорее относится к взрослому контингенту больных. Остальные бесспоровые виды выявляются с меньшей частотой, аналогично тому, как они представлены в нормальных отростках. Исключение составляют фузобактерии, отдельные виды которых, ранее принадлежавшие к роду Spherophorus, могут обладать значительной вирулентностью.
При такого рода осложнениях воспалительного процесса они обнаруживаются чаще, чем в нормальной аппендикулярной и кишечной флоре. Иногда они вытесняют и бактероиды, однако в большинстве случаев их численность составляет от ¼ до 1/3 числа бактероидов.
Бактерии выходят на поверхность флегмонозно или гангренозно измененного червеобразного отростка и проникают в брюшную полость еще до его прободения. В этой ранней стадии инфекционного процесса в брюшной полости можно выделить в основном аэробные бактерии, прежде всего Е. coli. Zavadova, однако, описывает два случая, когда из серофибринозного экссудата брюшной полости ей удалось вырастить в чистой культуре стрептококки группы G и Н. Еще до появления микро- и макроперфораций в отростке в серофибринозном экссудате, взятом во время операции, выявляются и анаэробы, преимущественно бактероиды. По мере прогрессирования воспаления в направлении гнойного перитонита анаэробных видов становится все больше.

Увеличивается также численность палочек из рода Proteus, Enterobacter и Pseudornonas aeruginosa. Флора, проникшая в брюшную полость благодаря защитным свойствам брюшины, может подвергаться редукции и полностью ликвидироваться; поэтому воспалительные осложнения при аппендиците развиваются лишь у нескольких процентов оперированных. Stone сообщает о 17% случаев инфекции в ране и 6% — в брюшной полости. В случаях, когда инфицирование брюшной полости обнаруживается уже на операции, послеоперационные осложнения возникают чаще. Смешанное инфицирование брюшной полости облегчает возникновение воспалительных осложнений, поскольку аэробные и микроаэрофильные бактерии своими метаболитами и протеолитическими ферментами снижают окислительно-восстановительный потенциал в месте своего размножения, обеспечивая тем самым возможность для проникающих одновременно и анаэробных видов. Последние интенсивно размножаются и вызывают гнилостно-гнойные процессы, характерные для анаэробной инфекции.

В качестве вирулентных факторов у анаэробных бактерий были установлены протеолитические ферменты (пептострептококки, вейлонеллы, В. melanino-genicus), деаминазы и карбоксилазы, под действием которых могут образовываться биологически активные амины и эндотоксины (бактероиды, фузобактерии).